戸籍は男性のまま女性として勤務する経済産業省の職員が、「戸籍を変更しなければ女性用トイレの通常使用は認めない」とした同省の対応は不当だとして、訴訟を起こしたと報じられていました。

私自身はこういったLGBTの方に対して偏見はない・・・つもりなんですが、
こういったケースはどうなんでしょう？

当事者の方が、「自分は女なのに男子トイレを使う」ということに対して、不快感と苦痛を感じるという事情はよくわかります。
昔に比べてLGBTの権利が世間的に認められてきた背景もありますが、権利があるからと言ってどこまで主張してもいいのだろうか？ということを考えさせられました。

一応、他の（女性）職員にも事情を説明して了解されていたようなので、単純ではないようですが、
では、もし他の女性職員の一人でもが、「いくらLGBTでも、男性（に思える人）と同じトイレを使うのは嫌だ、不快感を感じる」と主張したらどうなんでしょう？

片方が権利を主張すれば、もう片方の権利を侵害する、なんてケースが生じる場合もあるわけです。
こういった場合、どちらかが我慢しなければならないですよね。
そしてそれに正解はないのでしょうが、やはり少数派が我慢してください、となるのが一般社会なんではないでしょうか。

なぜこんなことを考えたかと言うと、たまたまタイムリーに一昨日書いたブログ記事（Tolerant society）に関連します。
少数派が社会の中で過ごしていこうとすると、どうしても「他人の寛容さ」に頼らなければならないことになります。
どちらが正しいわけではないはずですが、圧倒的に多い者の方が当たり前の価値観で社会は成り立っているわけですから。

少数派だって権利は主張したいです、不快感や苦痛も感じています。
でもそれを認めてもらって当たり前だと考えだすと、認められないことによる苦痛を感じることになります。

私は今精一杯できることをやっており、できないことに対しては大目に見てくださいよという考えが少なからずあります。
それは「寛容さ」に裏付けられたありがたいことであると感謝していますが、一方権利で認められているんだからできるだけ主張しようという思いもあります。

たとえば、就業制限があるから残業はできませんと権利主張したとしたら、その代わりに残業をしなければいけない人が出てきます。
つまり私が権利を主張することで、寛容な心を持った方の権利が一部侵害されるわけで・・・

難しいですね、
だからどちらかが我慢しろとか、権利を司法で争えと言いたいわけではないのですが・・

もちろん解決策なんて無いのですが、
せめて当たり前と思わず、自分が得する権利ばかりを主張せず、
常に感謝の念を持って周囲に接していくということが大切なんだろうなと思います。